公积金贷款和商贷是两种不同的贷款方式，其主要区别在于资金来源、利率、还款方式等方面。

首先，公积金贷款是指由职工个人住房公积金账户中的资金作为担保而获得的贷款。其资金来源主要是职工个人的住房公积金缴存额以及单位的住房公积金补贴等。而商贷则是由商业银行向借款人提供的贷款，资金来源主要是银行的资金池。

其次，公积金贷款利率一般比商业贷款利率低。这是因为住房公积金是一种福利性质的制度，旨在帮助职工解决住房问题，因此其贷款利率相对较低。而商业贷款利率则由市场供求关系决定，一般较高。

第三，公积金贷款的还款方式比较灵活。根据规定，公积金贷款可以采取等额本息还款法或等额本金还款法，借款人可以根据自己的实际情况选择适合自己的还款方式。而商贷的还款方式则较为固定，一般采用等额本息还款法。

此外，公积金贷款还有一些其他的限制条件，如贷款额度受到限制、贷款期限较短等。相比之下，商贷则具有更大的灵活性和适用范围。

总之，公积金贷款和商贷在资金来源、利率、还款方式等方面存在较大的区别。在选择贷款方式时，需要根据自己的实际情况进行综合考虑，并选择最适合自己的贷款方式。